這輛2224號列車原定從新竹開往基隆，發生命案後，並沒有直接開往樹林調車廠停放，反而在短短20分鐘內，完成包括傷者救援、疏散旅客、警察拍照，清理車廂等動作，6點50分隨即北上，到了板橋站開始有乘客上車，列車一路到了基隆後，又開往新竹，這時台鐵才接獲檢察官通知，把車廂開回樹林供警方採證，已經是隔天凌晨2點鐘，換句話說，這8個小時之內，發生命案的車廂都還載客營運，至少上百人進出命案現場，跡證幾乎被破壞殆盡。
18歲的大專生命喪火車車廂，但車廂裡頭卻乾淨的不像命案現場，明顯經過一番清洗，因為這原本該被保存的命案現場，卻在案發後南北走了1百多公里，才回調車廠讓警方仔細採證。
23日晚間6點半，李姓嫌犯揮刀殺人後，包括救援、旅客疏散、警察上車拍照、清理車廂等等，短短20分鐘全部完成，效率超高；6點50分隨即北上持續載客，才開到板橋就有乘客陸續上車，命案現場就這麼一路開到了基隆，之後再從基隆發車往新竹走，這時是命案發生後的4小時，台鐵才接獲檢察官通知，要把1到4節的車廂開回樹林調車廠保存證據，第五節以後的車廂照常營運，等到列車到達樹林時，已經是隔天的凌晨2點半。
換句話說，命案後的8小時，游姓大專生喪命的車廂裡，至少有幾百人次進出，沒人知道幾個小時前，車廂裡發生慘忍殺人案，而重要的兇案證據也被破壞了一大半，一條人命，怎麼會如此草率？台鐵板橋站務長徐明棋：「我們從來沒有發生過在車上，人那麼多的凶殺案，也是第一次發現。」
台鐵不知情，那麼負責偵辦案件的鐵路警察，難道不知道要保存命案現場的基本觀念？鐵路第一警務副段長張天賜：「可能第一時間，列車長沒有注意保存現場這部份。」
究竟是列車營運要緊，還是人命重要？也還好是有旅客幫忙逮捕兇嫌，否則跡證破壞殆盡，被害人的公道該找誰討。
