今年進口的棉籽多達1380公噸，衛福部與農委會聯合大清查，現在追出，共被5家廠商買走，稽查人員兵分多路到台南、嘉義和彰化，實地檢驗廠商是否有榨油設備，並且核對帳冊，希望追出棉籽的流向和用途，目前3家飼料廠和1家進口商進口的棉籽，都是拿來用做動物飼料使用，而另外1家則是還在確認當中。
衛福部人員來到大成長城位在，柳營科學園區的飼料廠，要追查進口的360頓棉籽的流向，就怕有人拿來榨油。
稽查人員：「我們現場稽核的結果，並沒有發現他們有榨油的設備。」
業者強調，棉籽買來全部進了牛羊的肚子裡，幫助反芻沒有其他用途，這個是世界普遍作法，今年到現在國內一共有5家公司進口總共1380公噸棉籽，業者通通說是拿來當飼料。
棉籽進口商：「做飼料呀。」記者：「那這些廠商有沒有做食用油的？」棉籽進口商：「沒有。」
另外這一家位在嘉義，棉籽進口量最多的三福公司，也表示代工做食品，沒用棉籽或提煉棉籽油，業者說法大同小異，但有學者質疑，為什麼業者不進口較便宜的棉籽粕做飼料，而是進口比較貴的棉籽卻不搾油並不合理，對此農委會說棉籽跟棉渣餅其實成本差不多。
農委會畜牧處副處長朱慶誠：「棉籽粕應該是每1公斤10元到11元左右，棉籽平均應該是9元多。」
農委會定調，廠商進口棉籽做飼料，不會殘留轉移到牛肉羊肉或菇類，而5家廠商中，目前已經確定4間公司沒問題，最後1間正在比對帳冊，確認用途和流向。
農委會畜牧處長黃國青：「那這個賣到哪裡，我們就追到他賣的(地方)，連發票什麼都拿出來核對。」
大統問題油連環爆，進口棉籽粕和棉籽的流向引來關注，就怕還有黑心廠商，還沒攤在陽光下。
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