藍軍的抗爭集結還沒結束，不過身兼連宋競選總幹事的台北市長馬英九卻自行結束了輔選角色，以首都市長身分極力協調希望國親抗議活動能在今晚10鐘之前結束。不過下午馬英九拜會過連戰後表示：他已經盡力，但還要看現場狀況，黨職跟市長職務的衝突，讓馬英九角色尷尬。至少面對群眾要他加入抗議行列，馬英九就拒絕了。
整整2天幾乎沒睡，台北市長馬英九露出倦容，親自赴國民黨主席連戰寓所，關切藍軍的抗爭遊行，卻已經跳出連宋競選總幹事的身分。
台北市長馬英九：「我身為台北市的市長，台北市的治安、台北市的秩序我都必須負責來維護，因此集會遊行，像他們(連宋)這種有頭有臉的人物，我們先跟他們希望他們能來約束，我是把我們的意思告訴他(連戰)，希望他們來配合。」記者：「今晚10點可望可以結束嗎？」台北市長馬英九：「我們希望是這樣。」
黨職跟市長職責的雙重身分，陷入兩難，甚至被外界形容是最艱困的處境，他自己怎麼看？
記者：「說您處於艱困時刻？」台北市長馬英九：「不會不會！我沒有失蹤啊！我沒有心力交瘁啊！」台北市長馬英九：「喔！我不行(加入遊行)，因為我已經銷假上班，恢復了首都市長身分，首都治安我要負責。」
話剛說完，立刻就有民眾從總統府趕到馬市長坐鎮的市警局，要勸說馬英九請假遊行去。
連宋支持者：「現在幾萬個人，我們就是等待馬英九出現，我們一直沒看到他來，我們都覺得很失望。」
其實藍軍支持者這樣的聲音早在開票當晚就已經喊出來，不過當時馬英九選擇低調不出面，終於露面也一句話都不說。連宋支持者：「市長不要氣餒，市長加油！」
直到隔天他才表達立場，堅持以市長身分不介入遊行，內心掙扎的歷程可以想見。
