仁愛醫師打人事件，市政府的懲處態度受到關注。據了解，台北市長馬英九原本授權主管單位，過完年再開會調查懲處，但消息傳出後，家屬不滿，中午經過90分鐘緊急危機處理，馬英九決定明天大年初一就立刻召開考績會，進行懲處作業。
邱小妹人球案爆發之後，馬英九第二度踏進仁愛醫院，原本是來發紅包感謝大家辛勞，不過卻變成醫生打人的說明會。台北市長馬英九：「張珩第一時間已經報告，仁愛向家屬道歉，要求醫生停職。」
仁愛醫院又「突槌」馬英九第一時間掌握全盤狀況，只是何時才要懲處，馬英九中午的講法是這樣的。台北市長馬英九：「過年後再說，提前..要評估。」
過年放假，不開會處置，被打的病患家屬心理不是滋味，認為市府拖延，而馬英九回到辦公室之後，在下午1點半鐘，和市立醫院總院長張珩，以及衛生局長宋宴仁通電話，馬英九決定充分授權張珩處理，經過緊急協調，市府決定，年初一的上午，仁愛醫院就要召開考績會，決定打人醫生的懲處方式，關鍵的90分鐘，市府的處置速度全面加快。台北市長馬英九：「見微知著，加強醫德。」
捷運掀頭皮事件，市府危機處理花了10天，邱小妹人球事件經過三次專案調查，真相才水落石出，這回醫生打人風暴，馬團隊第一時間知情，即刻要求醫師停職，但沒有立即懲處，曝光之後，危機處理決定隔日開考紀會，全面動員。
