針對陳總統過境美國，大陸外交部今天向TVBS透露，在陳總統出訪前，大陸已經向美方進行過交涉，也獲得美方做出三項承諾；至於大陸國台辦，則沒有做出任何評論。不過有大陸對台智庫學者說：大陸方面認為陳水扁這次在美國的言行，比1995年李登輝訪美「還要猖狂」。
針對陳總統過境美國，大陸外交部發言人劉建超在接受TVBS獨家專訪時透漏，事前已經跟美方進行交涉。大陸外交部發言人劉建超：「中國政府就陳水扁過境美國這件事情，事先已經跟美方進行嚴正交涉，陳水扁這次過境美國呢，主要有兩個目的，第一呢，就是要繼續從事他分裂祖國這樣的行動，第二呢，就是要破壞中美關係。」
劉建超是在參加海南博鰲亞洲論壇時做了以上表示，劉建超說美方對大陸做出包括支持一中、恪遵中美三個聯合公報，以及不支持台獨等三項承諾。因此目前看不出這會影響大陸總理-溫家寶12月的訪美行程。
至於國台辦方面只低調的表示，會持續觀察，暫時不作評論。大陸智庫對台學者則解釋，國台辦此舉是希望顧全大局，仍將保持立場明確，但不排除在洽當時機做出反應的態度。學者也認為，比較起1995年李前總統訪問美國，陳總統這次在美國的言論相當「過分」，充滿挑釁。實際上，由於中國大陸正在舉辦博鰲亞洲經濟論壇，東亞各國也相當關切兩岸議題。
章孝嚴表示，兩岸經濟在亞洲經濟體中扮演重要角色，台灣與大陸都不應該在政治議題上作太多文章。立委章孝嚴：「在東亞這邊，我昨天接觸到幾位會議的代表，他們表示說，這種政治議題在目前的潮流裡面是不太受歡迎的，目前各國都是以經濟為重，你還在炒這些老的題目，引起區域的不穩定不安的話，大家不樂見的。」
