檢調單位追查出，國安密帳當中，曾有一筆外交部88年間歸還國安局的鞏案代墊款項，在國安高層指示下，經由台綜院院長劉泰英洗錢，作為購置台綜院淡水及台北辦公室屋舍的經費，整個事件原委究竟如何？上午台綜院及劉泰英都不願對外說明，只強調，適當時機會以新聞稿說明。
TVBS記者張甄薇︰「這棟雄偉的建築物就是淡水台綜院，由前總統李登輝先生擔任榮譽董事長，不過就在追查國安密帳的同時，卻傳出整座台綜院以及台北辦公廳室的購置經費，就是來自88年間，外交部歸還國安局的鞏案代墊款項。」
這是三年多前李前總統卸任後接任台綜院榮譽董事長，陳總統盛大祝賀的畫面，當時台綜院院長劉泰英，更意氣風發，沒料到事隔三年多，卻在國安密帳風波當中追查出台綜院購置經費，竟然是來自國安密帳當中，鞏案的代墊款項。
根據檢調掌握的資料，88年間，外交部歸還國安局先墊付金援南非的代墊款項，其中國安局將多出的將近2億5千多萬元轉交劉泰英，整筆款項15萬美金由劉泰英支用，735萬美金則經由潤泰董事長尹衍樑洗錢，回流台綜院作為購置淡水台綜院，安泰登峰以及潤泰敦品等台北辦公室的購置經費。
根據台綜院現在的組織架構，除了李前總統及劉泰英仍擔任董事長及院長外，李前總統的女兒李安妮也出任台綜院副院長，劉泰英也曾坦承，他曾在李前總統指示下，從國安基金獲得2千萬，成立台綜院第四所，儘管整個事件台綜院及劉泰英本人目前都保持沈默，但是國安密帳中的錢到底有沒有流向台綜院，不久的將來將水落石出。
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