連宋大選架構定調，現在就差台北市長馬英九，究竟接不接總幹事，他還沒有點頭，馬英九擔心請假投入選戰時間太多，會遭抨擊，而其實親民黨對這項安排也有雜音，國民黨內也有立委開玩笑說：王要騎在馬上，才能稱王，顯然有黨內接班順位之爭的味道。
雖然立法院長王金平一再明確對外宣布︰台北市長馬英九即將接掌連宋競選總部總幹事，不過馬英九就是不肯鬆口。台北市長馬英九︰「工作上恐怕還需要調配才有可能，但一定會扮演一個角色(記者︰所以還沒確定接總幹事？)，對，還沒確定。」
馬英九的猶豫是因為如果要肩負起全國性選戰的操盤，必然得挪出更多時間請假輔選，更可能成為民進黨議員攻擊箭靶，因此遲遲沒有同意。而其實馬英九接總幹事，仍然存在雜音。親民黨立委龐建國︰「(記者︰馬英九的部分，你們親民黨也希望他趕快接？)，會有一些雜音，坦白講，因為馬市長的行事風格。」
雜音主要來自親份人士耿耿於懷，上次市長大選，宋楚瑜為馬英九下跪，但馬英九就是不肯讓宋楚瑜站台，讓親民黨有熱臉貼冷屁股的強烈尷尬，而這份心裡的痛，理智上只能從大局著眼。親民黨立委龐建國︰「連宋王馬這樣的陣容擺出來，我相信大多數人都肯定的。」
而國民黨內看王金平接主委，馬英九接總幹事，也有一番解讀。國民黨立委陳學聖︰「本來就是王騎在馬上才會稱王，大家自然會這樣講，開玩笑的啦！我覺得王馬要爭氣一點，甚至表現的要比候選人出色，選票就會回來(記者︰會不會王馬就是下次總統大選王馬配名單？)，這沒有人敢預料，因為時間變化很大。」
國親大選操盤架構，某種程度也在展現黨內接班順位。
