公投法完成立法後，陳總統上午在總統府內簽署公投法，陳總統說，這是歷史性的一刻，他還特別將簽署文件的用筆，送給了有「蔡公投」封號的民進黨立委蔡同榮。
上午九點四十分，在總統府秘書長邱義仁、民進黨黨團幹部的見證下，陳總統簽署了公民投票法，並且將簽署文件的用筆，送給了立委蔡同榮。總統陳水扁：「今天能夠美夢成真，蔡同榮立委大家叫他蔡公投，終於在今天，能夠名至實歸。」
不過，這部以國親版為主的公投法，陳總統曾經多次表達，還要再修法。總統陳水扁：「我們還要繼續努力，希望完成公投立法之後，公投這一個普世價值基本人權，能夠在台灣這塊土地生根，能夠真正為兩千三百萬台灣人民所可以擁有。」
而陳總統將在320總統大選舉辦防禦性公投，這一陣子，美國和日本等國家還是透過管道表達關切；甚至日本交流協會台北事務所長內田勝久，還親自和總統府秘書長邱義仁進行溝通。
總統府副秘書長吳釗燮：「我認為這個只是，因為中國的壓力下，日本方面把這個攤開來講，對中國有所交代，就是這樣而已。」
總統府重申會加強與各國溝通說明，而返國述職的駐美代表程建人，也在上午進入總統府，向陳總統報告與美方溝通的結果。
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