陳總統一再宣示320將舉辦防衛性公投，不過美國不斷透過管道表達關切，對公投投下變數，總統府秘書長邱義仁表示，目前美方最大的疑慮不是320公投，而是憂心2006年的制憲公投，台灣會不會走向獨立。不過邱義仁表示，他不相信有過半數的台灣人民會做出讓美方不知道怎麼辦的事。
公投宣導團即將前往世界各國進行溝通，能不能取得美方的信任，尤其重要，邱義仁透露，具有政策性內涵的防衛性公投草案，月底就會出爐，但是美方除了在意公投所使用的字眼，真正關切的，是更大的課題。
總統府秘書長邱義仁：「從美方來講，既然你要公投，那他發現你2006新憲法也是要用公投來處理，所以變成他整個公投，這一整組的東西，他都開始要去關切，假如陳水扁再當選，你在2006年即使只碰觸那12個(新憲)領域，理論上跟概念上，你不能排除人民自由行使他的權力，因為這是他的民主權力，他當然有權去要求我要正名，或者我要這個我要那個。」
說穿了，美方就是擔心台灣有可能在2006年制定的新憲，會走向台獨。總統府秘書長邱義仁：「連民進黨這樣被稱為台獨的政黨，在國際社會常常給人這樣一個刻板印象的政黨，經過了這十年內部的討論爭辯，還是有辦法尋求出一個折衷的台灣前途決議文，我覺得台灣社會的人會去幹出一些，而且是多數哦！包括公民投票多數會去幹出一個讓美方不曉得要怎麼辦，必須要去檢討他那一個(台美)基本架構的結果，我坦白講，我不太相信。」
邱義仁強調，台美數十年建立起的互動框架，不會因為公投就被改變，他主客觀都認為，與美方的溝通一定會成功；至於會引發戰爭、各國會撤僑等言論，他都把它定位是在野黨的選舉語言。
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