前國安會秘書長丁渝洲出回憶錄，副總統呂秀蓮也被記上一筆！丁渝洲在書中說，從呂秀蓮在就職典禮上所站的位置，刻意和歷任副總統不同，就可以看出呂秀蓮有很大的企圖心，她絕對不會甘於只是備位，對此，呂副總統氣憤的說，她完全是遵照總統府的安排，丁渝洲的說法，是官僚體系的舊思維！
2000年總統就職典禮上，副總統呂秀蓮站在陳總統身邊，聆聽演說，這一幕，在前國安局長丁渝洲看來，不太尋常。丁渝洲在回憶錄中說，當時總統府官員曾經兩度示意副總統回座，不過呂秀蓮還是堅持站在原地，聽完演說，並接受民眾歡呼，丁渝洲認為，這不但與例任總統的就職慣例不同，也顯示了呂秀蓮強烈的企圖心。
丁渝洲在書中還提到，呂副總統上任後，曾經要求視察國安局，不過丁渝洲認為備位元首，不應介入國安體系工作，於是透過當時的總統府辦公室主任馬永成報告總統，最後沒有成行。
仔細比較2000年陳陳總統，與96年前總統李登輝就職演說的情況，可以發現，過去總統就職演說，副總統的確沒有隨伺在側，但呂副總統自有一番解釋。
副總統呂秀蓮：「（記者：副總統，丁渝洲秘書長書裡面說...），這個我要回答，丁先生可以說是舊世代跟新世代，舊政權跟新政權交接當中一個官僚體系的人，他是可能用舊思維來看新問題，我個人對他那個指栽是完全無辜的，我怎麼知道整個總統府就職典禮的體制是什麼，我絕對是總統府怎麼安排，我怎麼做。」
副總統面色凝重，嚴詞駁斥，她強調，副總統是國家的備位元首，隨時都必須有備位的能力，陳總統也完全能了解她的想法，外界不應該有無謂的揣測。
