雪山隧道漏水問題，學者跟官方始終看法兩極，台大地質系學者擔憂，正值秋天乾燥季節，滲水問題就這麼嚴重，萬一遇到雨季，後果更難收拾，尤其雪山隧道處在破裂斷層帶上，恐怕很難避免隧道本體結構錯位的疑慮，但國工局還是強調，一切狀況都在掌控中，但問到究竟漏水有幾處，國工局長也回答不出來。
已經用小針美容修補過的牆面，又滲出溼答答的水，雪山隧道裡，到處看的見漏水跟修補的痕跡，放上衛生紙，看的更明顯。台大地質系教授劉聰桂：「沒有下雨的話，理論上這些地下水就相當的少，相當的少，水壓小，應該照說是比較不會滲水，現在反而有滲水。」
正值乾季，水壓正常情況下，漏水問題不單純，台大地質專家憂心，雪山隧道位於斷層破裂帶上，而且漏出來的水，他做過調查，屬於「年輕」的新水，表示水流源源不絕，嚴重的漏水問題，會不會是隧道的結構發生錯動移位，國工局長掛保證。國工局長邱琳濱：「目前整個團隊查核，並沒有這些現象發生，並沒有錯動發生，有些專家建議我們，作這方面的監測，我們也不排除。」
沒有錯位疑慮，正全面監控，再次強調漏水是單純的防水膜破裂問題，隧道本體結構沒問題，但令人納悶的是，隧道裡漏水究竟只有4處還是10處？甚至有新說法19處，國工局長回答不出來。邱琳濱：「我真的沒辦法跟你們講，到底有多少處，有多少地方發生這種(漏)狀況。」
到底漏水狀況能不能確實掌控，國工局的態度，讓用路人很難真的安心。
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