樺加沙颱風為金門帶來強烈風浪，22日出現8級強陣風並掀起7至9級巨浪，海象極差導致船隻紛紛避風。然而，北碇島與峰上中間海域卻有數艘懸掛五星紅旗的大陸漁船冒險搶捕漁獲，海巡人員頂著惡劣天候緊急出港驅離共10艘陸籍船舶。風浪影響持續至23日，導致小三通全天停航，共12航線110次停飛，飛機上午也無法起飛，香港旅客因資訊不足撲空，所幸下午獲得候補機票。澎湖雖航班正常，但持續降雨，當地居民需小心出行。金門、澎湖均發布強風特報，預計有6至8級以上陣風。
海巡署人員透過廣播警告這些船隻：「這裡不是碼泊區，請立即起錨離開。」最終成功驅離了10艘陸籍船舶。除此之外，還有商貨輪滯留在料羅外海。23日金門的風浪依然強勁，導致小三通全天停航，影響了12條航線，共110次航班取消。飛機部分上午也無法起飛，有香港旅客因不知情而一早就來到機場等候，結果撲了空。所幸這名旅客表示已經拿到下午的候補機票。當天機場只有零星幾名旅客，預計下午航班會陸續恢復起飛。
相較之下，澎湖地區航班運作正常，疏運也沒有問題，只有零星旅客需要候補。不過，澎湖持續降雨，當地居民穿著雨衣和拖鞋，小心翼翼地騎車上路。金門和澎湖都已發布強風特報，可能會出現6至8級以上的陣風，提醒民眾外出時要特別注意安全。
