毛巾是細菌孳生的理想場所，尤其在潮濕環境下容易積聚大量微生物，如大腸桿菌和金黃色葡萄球菌。這些細菌可引發皮膚感染、眼部炎症甚至呼吸道問題。要防止細菌滋生，應定期清洗毛巾，最好使用60°C以上的熱水並徹底晾乾。此外避免多人共用毛巾，並定期更換。選擇抗菌材質的毛巾也能有效減少細菌孳生風險。
臺大生命科學院院長暨小兒部主治醫師江伯倫：「在臺灣的話，相關的這些毛巾浴巾的問題，可能要更特別重視，那因為小朋友有點不太一樣，因為小朋友他使用上，他甚至可能，尤其使用上就隨手會拿來用，用完以後他可能就隨便丟，所以他比較不會像大人一樣能夠歸位。所以小朋友這個毛巾浴巾的使用上，有可能他的更換上，或是清潔上需要更頻繁一點。」
彰化秀傳醫院家醫科主治醫師張哲誠：「毛巾或浴巾在擦拭使用後，會沾染人體的皮屑、油脂或汗液，如果沒有定期清洗，或是放在潮濕的環境，久了會孳生病菌，除了會產生異味以外也會增加皮膚感染的風險。
彰濱秀傳醫院皮膚科主任黃星瑋：「臺灣這個環境，本身就是一個比較溫暖、比較潮濕的一個環境，所以當毛巾身上沾染了這些東西之後，時間一久再加上這個潮濕悶熱的環境，就很容易孳生細菌跟黴菌，成為細菌跟黴菌生長的溫床，那久了就慢慢會飄出異味。」
資深醫藥記者蔣志偉：「皮膚是人體最大的器官，人體皮膚每平方英吋大約有1900萬個皮膚細胞，650個汗腺。所以當我們洗完澡用浴巾擦乾身體時，一些死掉的皮膚細胞、汗水及油脂，就有可能殘留在毛巾上，剛好提供細菌及黴菌滋長的來源；2021年一項小型研究中，對大學生使用的50條毛巾，進行了微生物分析，發現所有樣本中都存在大腸桿菌。而殘留細菌或黴菌，除了會產生異味，反覆擦在身體上，也可能將毛巾上的微生物轉移到皮膚上，這些病原體也可能會引起感染或生病。」
林口長庚醫院兒童過敏科主治醫師/副教授葉國偉：「尤其是皮膚敏感或是，已經有皮膚病的人，很容易導致濕疹、黴菌感染如香港腳，灰指甲等。為了避免浴巾成為細菌和黴菌的溫床，/每次使用後能夠將浴巾完全晾乾，最好是攤開風乾或拿到室外曬太陽，/避免跟其他人共用浴巾，以防止細菌和黴菌的傳播，/對於小毛巾建議每2～3個月就更換一條新毛巾；至於浴巾則建議可6個月到1年，就更換一條新浴巾。」
毛巾清潔頻率？
林口長庚醫院兒童過敏科主治醫師/副教授葉國偉：「避免將濕毛巾丟進洗衣籃，因為濕毛巾中的濕氣可能會增加黴菌的生長，洗完後不要久放洗衣機中，盡快掛在通風良好的地方，攤開晾乾，防止黴菌生長，使用攝氏60°C以上高溫下洗滌毛巾有助於殺死黴菌。」
臺大生命科學院院長暨小兒部主治醫師江伯倫：「以大人的使用上面來講的話，我們可能一個禮拜毛巾已經也許一個禮拜需要至少洗個兩次，而且會建議大概至少有一次去拿去外面曬太陽。因為太陽還是一個很好的一個殺菌的一個作用，所以而且它可以讓它乾燥，因為我們的黴菌，如果在裡面一直長的話，其實對我們的整個身體都會不太好，我想主要是因為台灣，我們房屋內的一些有機物太多。所以一旦潮濕以後，這些細菌的滋生可能都會比國外來得更嚴重。
醫師建議應養成良好的毛巾清洗和保養習慣，定期更換毛巾，並避免多人共用毛巾，才能確保毛巾衛生，減少細菌感染的風險。
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