教育部針對公私立大學，除了有教學研究訓輔補助之外，還有高教深根計畫，不過這項是屬於競爭型經費，因此有學校認為，可能會有小學校搶不贏大學校的問題，但也有學校認為畢竟比計畫就是各憑本事，尤其教育部要求，一定要依照學校特色作為主軸，因此每間學校的本質本來就不一樣。
記者謝丹慈：「以東吳大學為例，像是在我後方的松怡廳，就是以國家級的音樂廳所打造的，因此有許多的社會人士，需要表演也會來這裡租借。」
東吳大學研究發展長王志傑：「那節流因為你面對少子化，很多你必須要每天擔心學生如果，錄取率不夠高或什麼，所以學校的各項節流的措施，包括節電包括省水，包括我們所有的一個行政程序上面，節能減碳這些措施都必須要一步一步到位。」
大同大學校長何明果：「一般社會習慣評比數量嘛，那大學校在一看的時候，有多少人出國啊，有多少什麼東西，它就是好幾倍嘛，所以看起來這個在評比的時候，大學校當然會佔便宜啦，但是如果我們仔細去看，如果對於譬如說這個學生的機會，學習的機會小，學校是比較高的，那他教學品質比較好一點，或者是如果你把這個經費除以人數的話，這個也許小學校的這個每個老師，所取得的研究計畫反而是多的。」
東吳大學研究發展長王志傑：「這幾年的高教深根計畫，他把研究加進來了，那研究加進來就會有產學合作，那當然每間學校的本質就不一樣，那公立大學他本身的產學合作，跟外面的產業界之間的連結，會比較深厚，當然某些私立大學，過去一直就在經營產學合作這一塊。」
教育部的高教深根計畫，是延續改良過往邁向頂大計畫，協助學校創新和提升品質發展特色，但每間學校本來就不同，實際能呈現的內容也可能有落差。
大同大學校長何明果：「如果拿到多一點，我們就把它辦得更活潑一點，給學生更多的資源去運用，那拿到少的時候，當然就也有應對的方式啦，那一般來講這個經費的穩定性，其實對學校的辦學是非常重要的，不管是多或少但是就是我希望，就是大家都期待的是穩定。」
對於私立學校而言，在少子化的浪潮裡辦學都艱辛，不過競爭型的經費本來就不是通盤補助，也只能是學校各憑本事。
教育部專門委員曾新元：「教育部113年高等教育經費，大概編了總共1276億元，那這個錢把它會分成三個項目，第一個是我們補助國立大學的教學研究訓輔，大概是507億元，另外大概補助私立學校的相關的教研訓輔的部分，大概是447億元，其餘的部分，大概是編在教育部高等教育司，技職司的兩個司作為補助各大學的相關的費用，那譬如說高教深根計畫。」
教育部說明經費的運用，主要還是以公私立大學的教研訓輔為主，其餘才是高教深根計畫，未來也規劃將經費拉高。
教育部專門委員曾新元：「我們的高教深根計畫，目前來講是屬於進入已經第二期的，另外一個五年的計畫，目前來講我們從去年開始以及今年，我們投入的經費是每年大概182億元，那預計在114年的經費來講，我們會投入在高達大概近200億元每年，那這些補助學校，我們會希望說，學校可以用來作為教學品質的改善，以及提升大學的競爭力。」
東吳大學研究發展長王志傑：「(教育部)它現在有所謂的精準訪視，其實就是到各校去看各校，學校只能說在每一個計畫內容上，更精準的去了解，教育部希望我們做什麼樣子的一個政策。」
透過校園的訪視，學校確實更能掌握方向，在爭取經費上更有目標，畢竟大家一起競爭同一碗粥，誰分得多誰分得少，都可能有怨言。
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