市售益生菌產品和優格、優酪乳都有好菌，那三者有何不同呢？營養師林俐岑表示，三者雖然含有好菌，但在製程上或是分類上都是不一樣的，所以無論是市售益生菌或優格／優酪乳，平時都要攝取。
林俐岑在臉書粉專「林俐岑營養師的小天地」與個人網站發文表示，益生菌的製作是先培養出具機能性的菌株，研究其功效，並且量產；而優格或是優酪乳則是將原料乳加入適合的好菌菌株，使其生長，所製作而成的凝態發酵乳製品。此外，還有諸多不同點：
成分原料不同
現在市售的益生菌，不再是以往最早期的消化道保健訴求，甚至有多種機能性的訴求，像是過敏調整的益生菌、代謝相關的益生菌、精神相關的益生菌等；優格的主要成分則是原料乳（牛乳、乳粉等）、益生菌、糖、香料等。
含有機能性益生菌針對特定族群做保健，對於改善健康更有感；優格、優酪乳富含蛋白質、脂質、醣類、鈣質及益生菌，日常飲用有助於維持消化道機能。
各自優點
現在市售益生菌很多都採單包裝，輕巧、方便攜帶、方便食用；此外，單純食用益生菌的熱量也相對低很多，可以減少額外的熱量攝取，在晚餐後或睡前吃，可進一步調理體質、幫助放鬆、擁有好心情。
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優格、優酪乳本身就是屬於六大類食物之一「乳品類」，每日可攝取1~2份，像是早餐就會將燕麥、新鮮野莓加入優格內搭配食用，或是下午肚子有些餓的時候，來喝一小罐無糖優格飲。
如何挑選
市售益生菌品牌很多，建議選擇具有研發能力的團隊，而且專注於益生菌研發的品牌，依照個人需求挑選，配方中有添加「益生質」的更好。
優格、優酪乳建議選擇使用良好乳源的牛乳，而非使用乳粉，而且盡量選擇「無添加精製糖」、無添加膠體、無添加香料的優格、優酪乳才是高品質的喔！（若話也是可以選擇，寡糖也是益生菌的食物喔！）
另外，林俐岑提醒，除了吃益生菌、喝優酪乳外，要讓腸胃順暢平時蔬果也不可少；有添加寡糖的產品也是很好的選項，但盡量選擇無調味的產品會更好。
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