隨着大陸新增確診人數激增，大部分都是境外移入病例，導致仇外情緒日益高漲，紐約時報引述報道指出，最嚴重的情況出現在廣州，非洲裔民眾在推特放上影片指控，在沒有被確診下被房東趕出家門，強制檢疫和沒收護照，強烈譴責有歧視和不人道對待，相關事件也引起非洲國家關注，奈及利亞眾議院議長召見大陸大使，給他看奈及利亞人在廣州遭歧視的畫面，並要求他向北京了解狀況、開啟調查。
畫面中，一群非裔民眾聚集在大馬路上，手裡還拿著大包小包的家當，他們拍攝畫面上傳推特，說人在大陸走到哪都被擋在門外。
非裔民眾：「沒有住的地方，你不能進去房子，你不能進去任何地方在大陸。」
另外網路上也有人PO出，大陸地鐵上所有乘客都和非裔人士刻意保持距離，相關事件引起非洲國家的關注，奈及利亞眾議院議長召見大陸大使，給他看奈及利亞人在廣州遭歧視的畫面，要求他向北京了解狀況、開啟調查。
大陸國家衛生健康委疾控局監察專員王斌：「無論是中國人還是外國人，我們目前採取的檢疫措施，包括各項防控措施，包括醫療衛生機構的救治，包括社區的網格化管理，都是一視同仁的。」
因為防疫衍伸的歧視風波，雖然大陸官方表示會採取行動，保證非洲公民合法權益，但也讓中非關係蒙上一層陰影。
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因應新冠肺炎疫情，疾管署持續加強疫情監測與邊境管制措施，
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