謝長廷在2008總統大選中，遭國民黨立委邱毅指控，曾當過調查局的抓耙子，謝長廷告邱毅毀謗，最後邱毅以無罪定讞，邱毅表示之所以判無罪，就因為他掌握確切證據，現在也可能反告謝長廷誣告。
國民黨立委邱毅：「謝長廷不是只領調查局諮詢委員的車馬費而已，是重要的戒嚴時期，有沒有做線民？有沒有做通訊員？有沒有領巨額的獎金？我們現在知道的有20萬，71年7到8月，在仁愛路招待所領的20萬這一次，別的有沒有？難道謝長廷你要像擠牙膏一樣，擠一點說一點嗎？」
民進黨立委管碧玲：「有解釋謝長廷絕不是線民，線民是諮詢人員，謝長廷的諮詢委員是什麼呢？是為了修陽光法案，找學者專家成立的諮詢委員會，根本不是線民，所以這個不起訴是很不公平的。」
國民黨立委邱毅指證歷歷，但謝系立委管碧玲回嗆，都不是事實，即使邱毅判無罪，也不代表謝長廷就是「抓耙子」。
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