大陸航艦跟戰機繞台之後，國軍為了提升防空能量，把原本直屬於國防部的防空飛彈指揮部，移編給空軍管轄，未來可以簡化流程、縮減發射時間，甚至將把重心移到東部地區，不過可以打到對岸的戰略飛彈，未來還是由國防部掌管。
大陸艦載機部隊司令戴明盟：「從飛行的結果來看，我們的人、我們的裝備、包括我們的流程，都承受住了考驗。」
大陸殲-15艦載機，密集在遼寧艦上進行起降訓練，對我空防威脅與日俱增之際，國防部著手應對準備把原本直屬於國防部的「防空飛彈指揮部」，3月移編給空軍，另外成立「空軍飛彈指揮部」。
這已經是飛指部成立以來第6次移編，未來負責高空防禦的愛國者三型跟天弓三型飛彈，以及中高空防禦的天弓二型飛彈，還有中低空的鷹式飛彈等，全部交給空軍管轄，不過戰略性飛彈，例如雄二E型，地對地戰術反制飛彈，發射的職權仍在國防部手上。
軍事專家陳國銘：「防空飛彈交給空軍管轄的話，當然就不用層層受限說，今天發射防空飛彈還要透過國防部，事實上不用，因為這個時機太慢了，打到內陸去，像大陸，像雄二E或中科院研發秘密型飛彈，這個可能就要由政府管轄比較好。」
飛指部職權移轉，就是要讓命令下達節省時間，而且因應大陸航艦戰機繞台恐成為常態，未來也將把飛彈部屬重心，放到東部地區。
軍事專家陳國銘：「沒有必要把所有防空能量跟防禦武力移撥到東邊，因為萬一大陸從事正規作戰，從西邊打過來的話，那時候怎麼辦？」
這是蔡政府上任後，第一次戰略單位的重大移編，相關單位已經接獲命令，不過國防部表示目前還在研議中，會依照敵情威脅跟作戰需求，作出審慎評估。
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