2016總統大選倒數60天，民進黨總統參選人蔡英文選擇在16日下午宣布副手，由中研院副院長陳建仁出線，說明他在2003年台灣面臨SARS疫情時注入穩定力量，也與競選團隊有良好默契，深信他會為國家加分！
蔡英文上台致詞：「記得幾個月前，陳副院長參與政策討論，那時蔡英文說『以後可能還有需要大力幫忙的地方』，那時陳建仁沒聽出真正的意思，但他已經被我寫在正式的名單裡，我在這裡正式宣布歡迎陳建仁副院長成為我的競選搭檔、成為團隊一員，我對他最深刻的印象是在2003年台灣面臨SARS疫情時，當年擔任衛生署長的他，穩健沉著的表現，並用冷靜、有條理的態度說明政府相關政策，對於惶恐的社會給予安定力量、帶來信心，也成功帶領台灣人民擺脫SARS陰霾，在這個時刻，我們要把更重要的擔子交到陳副院長身上，陳建仁以台灣發展為理念，不分黨派奉獻，是台灣的公共財，無人能否認。」
「陳建仁在這7年來一直擔任民進黨的智庫顧問，是重要諮詢對象，與團隊建立良好默契，個性開朗熱情、善於溝通協調，值得社會信賴。」蔡英文另外說明讓陳建仁擔任副手「能讓選情加分，但重點是相信他能夠讓國家加分」
蔡英文表示他們將會一起扛起責任，推動國家的進步與改革，蔡英文最後說「蔡英文不是一個人，『英仁配』不是兩個人，我們還有13個執政縣市長，未來還有改革過半、國會輪替的立法委員，我們將組成一支強大的團隊，穩健改革、包容團結，找回人民的自信，點亮未來的希望。」
民進黨副總統參選人陳建仁上台致詞：「台灣正面臨著選擇的關鍵時刻，我們是走向天堂，還是通向地獄，是迎向光明或者進入黑暗，是繼續衰退還是改革更新 ，都取決於台灣人民在2016年1月的重大選擇，每位深愛台灣的人都身無旁貸，當蔡主席徵詢我擔任副手意願時，我表示我必須分辨選擇 ，並請教我的太太與李遠哲院長，學術研究一向是我最喜愛的工作，一旦拋棄我喜愛的學術研究，從事公共服務，我確實有不捨與掙扎，我的太太和女兒為我祈禱，他們感受到天主的召教，要我成為天上的光、地上的眼，像一支小蠟燭點燃自己、照亮台灣，或是像一撮小鹽，融化自己，使台灣人民的生命更有品味，太太告訴我，天主教徒學者從政，可以把學術研究化為愛土愛人的實踐，她說『教宗方濟各也鼓勵從政，為政治帶來清新的氣象，特別照顧貧窮、關懷弱勢，政客一向是為一己之私而爭權奪利，政治家卻是從人民的需要看到自己的責任，方濟各教宗更說過，真正的權利是服務，好牧人要沾滿羊群的氣息，親自去照顧飢餓的、口渴的、無家可歸的人，李遠哲院長捨不得我投入政治鬥爭的漩渦，她希望我能繼續留在中研院，為學術研究奉獻心力，但憂國憂民的他，也提到台灣因應著全球暖化、環境變遷、糧食安全、生態危機以及社會不平等的種種問題，都需要迫切解決，他深信蔡主席的政見最具體、最可行，對於台灣的未來最有保障。在我規劃生技、醫藥的過程當中，我跟研究團隊與智庫同仁在一起，我看到蔡主席相當的辛勞，但她還是在早上7點至晚上8點多一再地與我們討論，她鞭辟入裡的見解，還有獨到的看法，讓我十分欽佩，更重要的是讓我了解，她要讓台灣更美好、更有戰鬥力，她的努力讓我感動不已。現在我願意站在這裡，全力支持愛與和平的播種者，促進台灣團結、翻轉台灣。」
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