陳水扁總統才在國慶日發表施政六大改革方向，行政院隨即召開記者會，由院長裁示，如何落實改革，不過，針對立院表決NCC草案時發生的流血衝突事件,院長也有話要說。
行政院發言人卓榮泰：「NCC法案尚未通過前，現有的法令應落實來實行，建立公平、合理的環境，立法院也讓社會付出相當大的代價，我們呼籲立法院朝野各黨團，公開、理性對話，並進行必要的協商。」
陳水扁總統口中的施政六大改革，行政院雖然提出具體做法，不過，首先對於上午立法院為了審NCC草案，發生肢體衝突，院長也有話要說，而針對總統所提的六大改革，關於退休人員所得替代率偏高的問題，行政院已經有了確切的做法。
行政院發言人卓榮泰：「即使沒有辦法在18%這個數字做變動，那麼會以他優惠存款額度的限制，以符合所得替代率上限訂為90%的對象標準。」
至於二次金改方面，不為合併而合併等四大原則將不會有所改變，政黨不當取得條例部分，有不當脫產和加速脫產者，擬由財政部去函或採告方式告知當事人和第三者。
行政院發言人卓榮泰還強調，不為立法院結構性的問題影響，民進黨始終改革的第一品牌，只是未來的政策還會怎麼變，實在沒有人敢保證。
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