不管是陳哲男還是林文淵事件，讓民進黨內傷不小，副總統呂秀蓮向陳總統建言，內閣應該改組，不論是選前或是選後，對此，行政院長謝長廷不敢苟同，他說目前不是改組的時候，立委林重謨更調侃呂副總統，再怎麼改組，也改不到她。
一場陳總統邀宴民進黨從政黨員，自家人的聚會，對於高捷弊案、禿鷹案，分別扯到陳哲男和吳乃仁，呂副總統認為施政出現缺失，建議乾脆內閣改組，不過，行政院長謝長廷認為，改組不是時候。
行政院長謝長廷：「內閣因為現在我們預算和法案，都在審查，有幾個法案還沒有通過，本來也是要改組的，像行政院組織法、NCC這類法案，都會影響到內閣，所以基本上 (內閣)現在不宜動。」
對於呂副總統提出內閣改組的想法，民進黨立委不是很給面子，極盡揶揄和調侃。
民進黨立委林濁水：「呂副總統講的話，我大部分很難了解。」記者：「怎麼說？」林濁水：「不能了解你還問我？要我掰嗎！」
民進黨立委林重謨：「（內閣）改來改去，怎麼改也改不到呂副總統。」
內閣有沒有必要改組，不是呂副總統說了就算，還是得看陳總統的意思，以及行政院長謝長廷點不點頭。
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