針對黨產及國會衝突亂象，陳總統直接點名國民黨主席馬英九，變的比連戰還好戰，希望民眾用選票，讓他覺醒，不過馬英九反批，因為民進黨內外交迫，陳總統氣急敗壞下，才會說出不是事實的話，強調自己一路走來始終如一，沒有變過。
馬英九變了嗎？馬英九，市長兼任黨主席後，陳總統首度公開評論，點名馬英九不再溫和，該為國會亂象負責。總統陳水扁：「我們實在想不到馬主席上任之後，(國會亂象)反而更嚴重，本來認為他很溫和，現在變成主戰派，親民黨宋主席把他綁住了，也是為了年底選舉啊，他的名字雖然沒有『戰』字，但是他比連戰還『戰』，真的啊！我就覺得怎麼會！」
國民黨主席馬英九：「我覺得真的非常有趣，也看得出來，民進黨最近內外交迫，陳總統已經氣急敗壞的程度，他說，很多事情，絕大多數不是事實，尤其他說我變了，我一路走來始終如一。」
馬英九以氣急敗壞反批，對於國民黨出售國發院土地，陳總統火力全開，馬英九也有定見。陳水扁：「明知道(國發院)是機關用地，怎麼可以賣？為什麼要賣機關用地，還要台北市政府配合變更用地？現在在中央有我在顧著，我不可能讓他們這麼做！」
馬英九：「國發院的土地交易，我們過程不但合法，而且合理合情，總統現在可以說，心裡已經心急如焚，有時候才會口不擇言。」
陳總統批馬，馬英九回批，扁馬上次在施明德的和解座談上談和解，真的只是曇花一現。
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