陳總統專機不飛美國，起飛前臨時傳出要改飛位在中東的黎巴嫩，不料專機在起飛7個多小時後卻傳出，黎巴嫩當局拒絕陳總統的專機降落，根據美聯社來自貝魯特的最新報導，黎巴嫩機場塔台是在最後一刻才告知總統專機機長，不能降落，理由是:國家安全因素。
陳總統專機起飛的前一刻，大家才突然發現，專機不是要飛往阿拉斯加過境，而是要轉往中東，媒體東打聽，西打聽發現總統專機要改飛黎巴嫩，不料飛機在起飛7個多小時後，黎巴嫩的貝魯特機場證實拒絕專機降落。
貝魯特國際機場經理：「我不知道原因，我們被指示不能讓飛機降落。」TVBS記者林宏宜：「你們有得到指示？但是你們有 得到指示，不能讓飛機降落貝魯特是嗎？」貝魯特國際機場經理：「是的。」記者：「你們剛得到指示嗎？」貝魯特國際機場經理：「什麼？」記者：「你剛收到指示，台灣總統不能降落貝魯特嗎？」貝魯特國際機場經理：「我不知道原因，然後我們接到很多問題，但是我們不知道任何理由。」
黎巴嫩拒絕陳總統過境，是不是受到政治打壓？
記者：「你們什麼時候收到 台灣的（降落）申請？」貝魯特國際機場經理：「在昨天下午，過了上班的時間。」記者：「你知不知道問題在哪裡？」貝魯特國際機場經理：「沒有得到允許！」記者：「是沒有得到允許？有沒有政治因素介入？」貝魯特國際機場經理：「我不確定，或許有，或許沒有。」
根據美聯社發自貝魯特的報導，貝魯特官方的確是受到中國大陸施壓，作出拒絕陳總統專機降落的決定，報導指出，大陸的大使還為此，緊急會見了黎巴嫩總理黎巴嫩的機場塔台最後被告知，因為黎巴嫩國安單位的要求，請塔台轉達台灣的總統專機，也就是華航的機長，貝魯特不能夠讓這架專機落地加油，最後總統專機，才轉往阿布達比降落。
扁座機降落遭到拒絕，貝魯特表示由於與中國大陸關係良好，不得不做此決定。
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