在總統宣示權力下放後，民進黨新潮流系大老吳乃仁，也決定辭去證交所董事長職務，為政壇再投下震撼彈。對照剛被留任的國安會秘書長邱義仁，同為新系大老，一人走，一人留，兩人做出不同選擇。
揮揮衣袖，新系大老吳乃仁要辭去證交所董座。這個決定與同為新系大老、剛被留任國安會秘書長的邱義仁，截然不同。
一位是黨內智多星，一位在扁政府金融佈局下呼風喚雨，一人走、一人留，但翻翻民進黨的歷史，兩人地位都無可取代。
大大的黑框眼鏡，格子襯衫，這是走過黨外時期，年輕時的邱義仁，跟邱義仁同樣身為新潮流創始人，當年在黨外生耕雜誌社的吳乃仁，還為了新聞局查緝，當場跟新聞局工作人員搶起書來，隨著民進黨第一屆中常委誕生，吳乃仁、洪奇昌等新系要角更加活躍，而邱義仁、林濁水與陳菊，更不曾在黨內重要活動中缺席。
民進黨秘書長吳乃仁(2000.6.26)：「將來的黨政之間，黨會處在比較，被動輔助的角色。」
2000年政黨輪替，吳乃仁發揮黨內影響力，走過民進黨秘書長、台糖董事長到證交所董座，吳乃仁一直是扁政府時代的新系要角，卻也因為禿鷹案與陳哲男濟州島案一度陷入風暴。
至於邱義仁從從民進黨、行政院、總統府到國安會，是台灣政壇上唯一歷經四大秘書長職務的人。然而長期跟隨陳總統左右，邱義仁逐漸退出派系運作，身為民進黨最強操盤手，邱義仁的「不敗神話」，卻也在去年三合一選戰中破滅。
國安會秘書長邱義仁(2005.12.4)：「看到我沒有用，我這個是廢物，你找我幹什麼？」
如今新潮流兩位要角的決定，黨內有不同評價。但不變的是，兩人已為新潮流奠定民進黨內無人敢輕忽的地位，隨著時局演變，兩人選擇不同的道路。
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