在馬英九因為特別費，遭到起訴的消息傳出之後，國民黨榮譽主席連戰晚間也發出聲明稿表示，他深信馬英九的清白，同時，連戰也在聲明中表示，馬英九的特別費跟陳水扁的國務機要費是不同的，不能混為一談。
國民黨榮譽主席連戰，在獲知馬英九因特別費案遭到起訴的消息，晚間立即發布了一封聲明稿，表示支持馬英九以任何行動來位自己洗刷清白，同時，連戰也強調，特別費的使用是一種通案，認為這跟陳水扁總統的國務機要費案性質是不同的，他認為陳水扁及民進黨團用兩種標準，把兩案混為一談。
同時，連戰也在聲明中表示，國民黨是個經得起考驗的政黨，全黨此刻應上下同心，贏得人民的支持。
◎連戰聲明全文：
榮譽主席連戰對馬英九主席遭起訴的聲明
一、關於馬英九主席遭到起訴，本人至感遺憾，馬主席從政以來，兢兢業業，相信國人對他的清廉都有信心，我們支持他為洗刷自己的清廉而繼續努力。
二、政府官員的特別費使用標準是通案，這與陳水扁使用總統的國務機要費性質完全不同，陳水扁與民進黨卻將兩案混為一談、等同而論，明顯是在操弄法律，顛倒是非。今天的起訴掩蓋不了當政者多起貪腐舞弊的事實。
三、面對馬主席辭職，本人深信國民黨是個經得起考驗的政黨，有能力應變，此時此刻，全黨上下，唯有團結一致，爭取人民的支持，以贏得下一屆立法委員和總統選舉的勝利。本人作為黨的義工，將繼續與全體黨員共同勉勵，共同奮進。
