張俊雄接掌行政院長，內閣改組如火如荼的進行，改組過程中也嗅出陳總統與謝長廷的角力，傳出包括總統府秘書長人選與行政院秘書長人選，兩人有不同意見；不過謝系立委表示，人事安排會尊重總統，至於被外界點名包括李應元與葉菊蘭，是否會進總統府或行政院任職，謝系立委都否認。
總統在宣布將換閣揆的隔天，和謝長廷同台蓋手印，兩人不時咬耳朵，關係是親密還是緊張，微妙氛圍從內閣改組見端倪！外傳總統府秘書長人選，陳總統屬意前新潮流大老洪奇昌，謝長廷則推薦「SAY YES」呼聲高漲的葉菊蘭；行政院秘書長人選也喬不定，陳總統傾向讓陳其邁出任，謝長廷則力推卓榮泰。
誰放什麼位置，牽動誰能掌控多一些的行政資源，究竟謝系人馬有多少人能夠入閣，謝系立委先給這樣的答案。民進黨立委黃劍輝：「總統府現在兩位副秘書長，總統他有個整體的規劃，李應元李前主委在現階段，他並沒有想要重回內閣的想法，葉前市長(葉菊蘭)已經規劃出國，去做她個人一些學習之旅的工作。」
言必尊扁，謝系人馬也試圖破除外界質疑謝長廷對內閣改組施壓的流言，面子與裡子，都得兼顧。
