藍白協商卡關，雙方針對民調算法比較基準就有落差，尤其是在誤差範圍認定，因為當初協議只提到這四字，民眾黨柯文哲說他只願意讓3%，但國民黨搬出統計學理論，按照誤差範圍定義就是在正負3%，也就是一共6%。
坐在電視機前緊盯兒子記者會，柯媽媽聽到藍白協商卡關就有氣。
柯文哲媽媽：「不合理啦，你們黨比較大人更多，為甚麼叫我們小黨要讓你，說甚麼瘋話。」
但公布的6分民調中，其中世新大學這份，若按照藍營算法，誤差範圍正負2.94%，也就是5.88%以內，那比較出來的5.19%應該是侯柯得分，為甚麼公布是柯侯，據了解因為一開始以為要合了6比0怕尷尬，乾脆差距較小這項讓柯得一分。
馬辦發言人蕭旭岑：「如果依照11/15兩黨協商共識，在統計誤差範圍內這樣的原則，侯柯配對柯侯配是5比1。」
原本的6比0因此就成了馬辦公布的5比1，而且現在雙方針對誤差範圍也有歧見，柯文哲主張他是說總共3%也就是誤差範圍正負1.5%，國民黨認為明明大家說好「誤差範圍」侯柯贏，那按照統計學就是正負3。
文大廣告系教授鈕則勳：「(協商)似乎只有提到正負誤差，而沒有去給它一個操作型定義，或者是沒有精確了解，彼此對正負誤差看法。」
事實上光是從比較基準，民眾黨主張「淨差」算法，也就是侯柯對決賴蕭的差距，去剪掉柯侯對賴蕭再看是否在誤差範圍內，國民黨則是直接柯侯對比侯柯，但專家說民眾黨算法不符合統計學，以聯合報民調為例，樣本誤差正負2.9%，侯柯配是42%，則其支持度是44.9%至39.1%區間中的任何一點，賴蕭配36%，那支持度落在38.9%到33.1%的區間，互減誤差範圍也會因此加倍成5.8%，變成0.2%到11.8%，藍白協商說好的科學，恐怕最後還是得回歸政治考量。
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