去年選舉期間，前國安局長陳明通指導台大國發所學位論文引發爭議，包含前新竹市長林智堅、政院副院長鄭文燦的論文都被認定抄襲，陳明通也被質疑違反學倫。今（14）日台大調查結果出爐，認為陳明通雖有指導不周等違失行為，但情節未達解聘程度。意指陳明通將能順利退休、保住退休金，讓檢舉人王鴻薇火大開砲。
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除了林智堅和鄭文燦的論文案，台大去年7月21日至8月11日間，也陸續接獲4位民眾具名檢舉陳明通違反學術倫理。台大也依教師懲處要點及其他相關規定，成立小組啟動調查。經三級教評會的審議，認定陳明通確有指導不周等違失行為，惟情節尚未達應予解聘之程度，故作出不予解聘的決議。
台大提到，學校雖不能遏止已經發生的事，但會深刻檢討、引以為戒，未來也會努力防範各教學單位再有類似情事發生。學校已於6月2日教務會議中通過「精進學位論文品質實施辦法」、「精進學位論文訪視委員會組織及運作辦法」等配套法規 ，內容包含開設學倫課程、各系所的自律共識及資訊公開，以及對於多次發生違反學倫的系所，校方將組成訪視委員會進行訪視等措施，盼藉由多管齊下營造良善學倫環境。
學論案調查結果出爐後，檢舉人、國民黨立委王鴻薇也大表不滿，「台大對於陳明通的違反學倫顯然是力挺到底。即使台大認定陳明通有違失，但是畏於陳明通的特殊身份仍然不解聘，就是要將這份退休金，當作阿通師的畢業禮物。」
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王鴻薇對於台大做出的結論也深表遺憾，「台大容忍陳明通違反學術倫理，濫用職權拿學數術作政治服務，也對國家高等教育未來感到憂心。陳明通成為最壞的示範，指導市長、行政院副院長論文抄襲，民進黨、台大都為其粉飾太平，還可以風光退休，政治干擾學術再添一筆。」
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