海協會長陳雲林抵達台灣，國人持續關注馬陳會究竟會不會談到政治議題？對於媒體報導，馬總統將當面向陳雲林表達，希望對岸撤除對台飛彈，馬總統上午出席公開活動時沒有回應，總統府也相當低調，不願評論，不過根據了解，馬總統已經強調會向陳雲林轉達台灣民眾的心聲，這當中當然不排除撤除飛彈。
記者：「總統要撤飛彈嗎？陳雲林會叫總統『先生』嗎？」馬總統：「…。」
從敏感稱謂到馬陳會，談哪些議題？陳雲林人都到台灣了，總統府還是不評論，不過上午馬總統出席全球衛生領袖論壇，從這段談話不難嗅出端倪。
總統馬英九：「如果我們有機會參與，世界衛生組織，我們不僅僅是受惠於WHO的專業服務，我們不只是一昧接受的國家，也是有所貢獻的國家，因此我們加入WHO或相關組織不是政治議題。」
在陳雲林來的這一天，馬總統大聲疾呼，台灣有加入國際組織的責任與義務，根據了解，6日下午在台北賓館登場的馬陳會，馬總統同樣將當面向陳雲林轉達台灣人民的心聲，當中包括台灣要參與國際空間，以及要求中共撤除瞄準台灣的飛彈。
根據規劃，與會人員我方包括國安會秘書長蘇起、總統府秘書長詹春柏，以及海基會董事長江丙坤夫婦，大陸方面，包含陳雲林夫婦、海協會副會長鄭立中、孫亞夫等人，到時候將採取半公開方式，在馬總統和陳雲林各自發表談話後，進行閉門會談，會後由兩岸各自發布新聞稿，保留各自表述的空間。
馬英九(2008.10.29)：「不管他怎摩稱呼我，我都是以中華民國總統的身分接見他。」
馬總統強調對等、尊嚴，不過總統府認同的對等標準，能不能為多數台灣人民接受，馬陳會的每一個細節都將被放大檢驗。
