葉盛茂在陳水扁擔任總統任內，坐了將近7年的調查局長大位，可說是陳水扁的親信，但是今天卻選擇出來坦承，公文正本交給陳水扁，甚至還說檢察總長陳聰明知情，讓他和陳水扁之間多年的信賴關係，面臨重大考驗。
從8月29日遭到起訴之後，葉盛茂經過幾天的沉潛，終於決定要把話說清楚，不過這樣一來，也把多年和陳水扁之間信賴的關係，面臨重大考驗。
2006年尾牙，葉盛茂還坐在主桌上，除了行政院長，就屬他最靠近陳水扁，在陳水扁心中地位可見一般；不過葉盛茂似乎也不是全然服從，即使已經把疑似涉嫌洗錢情資的正本，交給陳水扁，但是卻偷偷留了影本。
葉盛茂委任律師杜英達：「習慣性的作法，所以你們可以看到，為什麼會查扣到一些SOGO案的一些相關資料，其實這是他習慣性的作法。」
律師解釋，他是多年的習慣，但是自始自終葉盛茂完全知情，而且還一口咬定檢察總長陳聰明也知情；陳聰明當然不甘心被拖下水，馬上否認。
檢察總長陳聰明：「他的公文，第一件公文出現的時候，他已經沒有向吳前總長報告看來呢，他後來這個公文，不可能再向我報告。」
原本是關係親密的戰友，但是隨著弊案雪球越滾越大，葉盛茂也擋不住排山倒海來的壓力，就在對調查員深深對不起的同時，其實也是向陳水扁說「對不起」。
