國務機要費的機密檔案，究竟要不要解密？總統府今天終於有了答案，馬英九總統已經確定，要「註銷」國務機要費的絕對機密檔案。
幾個月來總統府審慎檢視，認為國務機要費檔案並不涉及機密問題，因此今天上午決定，要註銷國務機要費的機密設定。
國務機要費中的六大卷證，包括南線專案等文件，被陳前總統列為機密，使得偵辦上出現困難；之前總統府方面同意檢調偵辦這起案件時，可以使用機密檔案，但尋求法務部的解釋，認為機密檔案是不可以複製的，偵辦再度受到阻撓，因此總統府方面今天決定註銷機密。
所謂「註銷」和「解密」有認知上的不同，「解密」表示該檔案曾經是機密，如今進行解密，而註銷則意味著該檔案原本就不是機密，因此進行註銷。
下午總統府方面，由祕書長詹春柏召開記者會說明整個決定註銷機密的過程。根據國家機密保護法第20條規定，原核定機密的機構（總統府）同意的話，就可以使用，但是使用上仍要遵照國家機密保護法第25條規定。
儘管如此，但司法單位據此規定進行司法程序時，發現仍有不足，因此在6月初和總統府方面連繫，希望可以解密處理，以便高檢署持有的資料可以繼續使用，對此總統府方面謹慎看待，調閱多方資料後，認為其中並無涉及國家機密保護法，也就是「經披露後會危害到國家利益或傷害國家利益」，因此決定以註銷機密處理，整個過程合乎國家機密保護法第10條規定。
至於註銷國家機密等級的檔案，包括了90年到94年度，總統府提供君悅飯店開立的統一發票，報支國務機要費的明細表、89年1月1日到95年6月30日，總統府支領國務機要費檢具的單據、89年1月到95年6月30日，國務機要費相關的資料，包括7本預算書、7份國務機要費各月份的分配表、國務機要費支出報告表影本、89年1月1日到92年6月30日，經領款人簽收用印的支出傳票影本等，都註銷機密等級。
