前總統陳水扁在卸任後，首次以被告身分出庭應訊，在法庭內陳水扁一開始堅持站著接受訊問，而對於6月16日為何沒出庭，陳水扁答辯另有要事，法官追問到底為什麼，陳水扁說，這是機密不能講，不過法官還是裁定，下次出庭，陳水扁一定要把不能到庭的證明準備好。
卸任後首次被當作「被告」踏進法院，陳前總統放低姿態，沒直接坐下反倒是先向審判長深深一鞠躬，但低頭整理文件的審判長沒看見，一開始就問前總統「6月16日的庭訊為何沒來」？聽到問話，前總統立刻起身，審判長請他坐下，但堅持站著的他回答說「16日當天和一位非常重要的人士會面，所以不得不請假」；審判長接著問「你不能來，怎麼也不和律師說原因也沒書面證明呢」？前總統回說「事先有請律師請假，不過由於事涉機密，所以不便和律師透露」。
審判長馬上追問「那你今天是不是可以說行程內容了？事涉機密真的不能說」！聽到前總統不肯透露半句，審判長裁定「法院將會參酌『機密』的說法，同時再請他坐下答」。
但沒多久，拿出一疊文件答辯的前總統又站了起來，逐字逐句唸著他被告誹謗的專訪內容，大約照稿唸了半小時後，前總統話鋒一轉的說「雷學明等捅出這麼大的紕漏，沒有慚愧道歉，竟控告總統來轉移，我是公眾人物，不只是我包括我的家人，動輒被誹謗，要告也告不成，沒想到，卸任後第一個面對的官司，竟是拉法葉艦案」，帶點火藥味的攻擊頗有陳律師的味道，但雷學明的答辯卻是充滿溫情攻擊；雷學明首先謝謝審判長，這麼快開庭，「因為之前有一個涉案中將先走了，恐怕不久後，我也很快就會過世，因為我也得了癌症」；聽到雷學明這麼說，也在場的女兒和妻子忍不住淚灑法庭。
整個庭訊就在互有攻防中，歷時2個半小時結束，最後審判長裁定，被告陳水扁還是得將6月16日，因有行程未能到庭之證明，在下次庭訊時提出；看來三問三答的不能出庭理由未能讓法官滿意，前總統真的得好好交待不能說的機密到底是什麼。
