大考中心在上個月底通過今年大學指考報名費的調漲案，卻意外引發教育部和大考中心互槓，教育部認為大考中心財務不透明，調漲案是偷渡闖關，然而大考中心卻說，漲價是為了因應，教育部不斷修改的課程綱要，所必須支付的研發費用。
大考中心以臨時提案的方式，通過調漲今年大學指考費用，教育部重砲痛批大考中心偷渡闖關。教部高教司副司長王俊權：「正式討論時，並沒有把調漲案，列為正式提案，現場就我們所知，也沒提供完整的財務資料，所以討論時，我們認為有夾帶之嫌。」
以目前大考中心通過的漲價方案來看，簡章一本從原本的30元，調漲到40元，集體報名費也漲了50元，變成了250元，另外每報考一科要加收20元，換言之，考生9科全報，今年得繳1780元，大漲了230元。
不過大考中心還說，就算漲價之後，還得再虧500萬。大考中心副主任洪冬桂：「我們不僅負責命題、試務，最重要的是研發，所以一但課綱改變的時候，像95課綱98課綱一直來，對我們的研發案，就必須付出比平日更多的研發費。」
不談紙張漲價，也不提閱卷老師的工時要調整，大考中心把這回漲價的理由，推回給教育部不斷修改的課程綱要。
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