2010年，馬總統和當時民進黨主席蔡英文，為了ECFA進行辯論，自由時報隨後公布民調，和其他報紙結果都不同，成功訪談人數也比其他民調多，引來政論節目主持人董智森質疑，自由時報民調是假的民調，說數字是編的，被自由時報一狀告上法院；事隔2年，二審判決出爐，高院認定自由時報確實無民調中心，維持一審判決，董智森勝訴免賠，至於自由時報強調，還會再上訴。
前年雙英針對ECFA議題首度攻防，先引爆自由和中時兩大報、民調大戰，沒想到政論節目主持人董智森緊接著也在節目上，質疑自由時報民調是假的民調，董智森還說數字是編的，說自由的民調中心只有1個人在那邊，編數字。
隔天自由反擊，控告董智森，要求償150萬，並要求刊道歉聲明，結果高院判決結果出爐，董智森勝訴；不過，當年自由時報刊登辦公室多人打電話照片，聲稱有64名訪員做民調反擊，但針對外界疑問，並沒有再多的解釋。
記者(2010.4.29)：「感覺上不像是專業的民調中心，發言人不知道有沒有要回應？」自由時報發言人蘇宇暉：「不回應這個問題。」記者：「會不會開會決定公布錄影錄音？」蘇宇暉：「目前不方便透露。」
法官認定，自由時報是國內四大報之一，應該比照其他媒體進行民調的嚴謹程度，才符合民眾期待，而且認為董智森已經盡查證責任，確實足以使人懷疑自由時報民調的真實性，維持一審認定，判董智森勝訴免賠。
目前自由時報對法官認定沒有民調中心這個說法，無法接受、表達遺憾，強調一定會再上訴。
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