八八水災初期，讓軍方承擔救援不力的罵名，這次國防部超級總動員，連空中預警機都將升空，協助山區救災部隊無線電通聯，台北市憲兵部隊，也準備了32輛具有涉水能力的裝甲運兵車，不過似乎有點「緊張過頭」，部分地區官兵還收到W36命令，在颱風登陸前就被限制休假，沒辦法和家人共度中秋節，結果引起反彈。
接到命令，憲兵202指揮立刻整隊，10分鐘內出動救援；這款V150裝甲運兵車涉水高度150公分，台北市部署32輛支援，軍方還派遣連絡官進駐各區，第一時間就能掌握狀況。憲兵勤務科長文念宗：「編組連絡官12個在第一時間，抵達各(北市)行政區應變中心，跟我們做及時通聯。」
不只地面部隊，國防部甚至動員E2T空中預警機升空，協助勘查地面災區狀況，還有9架C130運輸機投入救災準備。空軍427聯隊長劉守仁：「受地形影響無線電無法通達，我們把E2T/K放置災區上空，可以經由它的管制從上往下，可以克服地形影響。」
軍方這次幾乎史無前例動員，甚至發佈W36命令，要求部份地區官兵，在颱風警報發布36小時內，管制休假，引起反彈。國防部軍事發言人虞思祖：「共體時艱，我們彈性調整休假，事後一定會補休。」
只能說88水災的教訓太沉重，上至總統、下至官兵，政府沒人能再承擔失去人命的代價。
