新流感疫情擴大，專家意見紛呈，前衛生署長陳建仁預估，台灣死亡人數會高達7千人，但同樣也是前署長的詹啟賢不同意，他認為這話只說了一半，即使沒有新流感，台灣一年也有近5千人死於一般流感，防疫如果分黨派，不是人民的福氣。但詹啟賢只在國民黨中常會說出心聲，面對鏡頭時，一聽到陳建仁3個字，還沒聽完問題就說不予置評。
前衛生署長陳建仁(2009.8.26)：「我們估計死亡人數在6900人左右。」
陳建仁這番話，讓同樣當過衛生署長的詹啟賢私下批評，把新流感死亡人數估得太高，太過聳動，但面對鏡頭就什麼都不講了。
前衛生署長詹啟賢：「怎麼了？」記者：「董事長，就問一個問題，陳建仁前署長，他之前講說7千人…。」詹啟賢：「喔，那個沒有評論。」
聽到陳建仁3個字，詹啟賢立刻搖上車窗拒絕再提。現任的衛生署長楊志良回應，陳建仁的預估，他尊重但不評論對或錯。衛生署長楊志良：「(講)比較嚴重，大家比較有興趣啦，我們如果講疫情太輕鬆了，大家又…又放鬆啦。」
前一天，詹啟賢在國民黨中常會，談到專家對新流感的看法，他認為，「有人」話只講可怕的那一半，即使沒有新流感，台灣每年仍有4、5000人，因為季節性流感死亡，詹啟賢說民進黨有些人，用「聳動言語」發表新流感相關言論，但「這些人過去也在衛生體系服務」，當初這些人在他們的位置上，也呼籲大家要冷靜。
詹啟賢遺憾的是，這些人不尊重過去服務的體制，逕自在外頭高談闊論，防疫分黨派，根本不是人民的福氣，但防疫上下一心，詹啟賢批判之餘，也謹慎拿捏不再發言，不想成為下一波防疫口水戰。
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