民進黨預計在年底前完成反滲透法三讀，但沒有經過委員會就逕付二讀，被認為根本是黑箱作業，過去318學運反服貿，也是以反黑箱為訴求，但過去反服貿的太陽花成員，大都認為這次反滲透法，沒有黑箱問題。
民進黨副秘書長林飛帆：「反滲透法並不是倉促立法，反滲透法的討論在國會裡面，從今年的年中開始，已經非常長的一段時間，相關的法案每個黨團都有提，只有國民黨沒有提。」
民進黨立委候選人賴品妤：「反滲透法跟反服貿不一樣，反滲透法我剛剛講，是很多專家學者長期以來意見整理匯集匯流，我覺得這部法案不是非常倉促的立法。」
強調兩者本質不同，但這樣的看法，就讓國民黨立委批評雙重標準。
國民黨立委賴士葆：「太陽花來講的話，過去來講就一直強調程序正義，現在怎麼不強調，好歹在委員會裡面半分鐘啊，是不是，他又沒有直接逕付二讀，現在不是半分鐘，是零分鐘。」
國民黨立委候選人林郁方：「請問你下令月底就要通過，請問你時間在哪裡？」
外界也質疑，過去強調新民意，但現在卻要趕在選前，強行通過反滲透法。
民進黨副秘書長林飛帆：「新的民意，到底在這個立法過程當中，不同的程序，大家對程序不同的想像，各個黨團都可以有所主張，未來的國會裡面，是會有吳斯懷和葉玉蘭這樣的人，這樣的人在國會裡面會主張怎樣的態度？」
反服貿的焦點黑箱問題，這次反滲透法是不是也存在程序問題，備受爭議。
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