民進黨過去從在野成功執政，選戰操盤大將之一，就是新系大老吳乃仁，現在傳出他即將出任民進黨秘書長，黨內派系激烈反彈，扁系立委暗示會有出走潮，嗆聲這可能促成台灣獨立黨成立，不過黨主席蔡英文出面證實，這是「現在進行式」，顯然意志相當堅定。
民進黨新任秘書長，真的是吳乃仁嗎？民進黨主席蔡英文：「這是在進行中的一件事，主要是考慮到吳乃仁先生，在黨的資歷跟輩分。」
吳乃仁是新系創流大老，重出江湖在黨內引起大地震。前考試院長姚嘉文：「吳乃仁是聰明人，他知道黨跟新潮流不同。」
民進黨立委高志鵬：「他在擔任新潮流總召，還有所謂台灣新社會智庫的董事長，說是新系的轉型，這樣兩個雙重職務，有沒違反（派系任黨職）內規，更擔心所謂台灣獨立黨更因此而加速成立壯大。」
從扁系到美麗島大老人人反彈，因為吳乃仁雖然戰功彪炳，選舉操盤勳章數不清，但「新潮流」目標明顯，人緣實在太差。民進黨立委田秋堇：「我是覺得說『偏向虎山行』，年紀那麼大了，滿佩服他的。」
消息傳出來，吳乃仁第一時間不願面對媒體，黨內反應可以預期，出馬應該只是時間問題。
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