特偵組追查陳水扁機密外交案，有週刊報導，前FAPA執行長陳文彥疑似將80萬金匯到台灣，之後又轉匯到某家平面媒體，理由是支付扁政府入聯公投的廣告費；檢方日前傳喚幫忙匯款的陳文彥胞弟，他強調只是出借帳戶，不清楚錢的來源，但檢方懷疑，可能和扁家海外密帳有關，已查扣帳冊明細清查。
陳水扁所謂的機密外交，近千萬美金的資金到底是花在哪裡？有週刊報導，特偵組查出，在2002年，當時的APA的執行長陳文彥，曾經從美國匯了80萬美金，到台灣一家私人的貿易公司，追查後，才發現這家公司老闆是陳文彥的胞弟，他又將戶頭中的75萬美金，轉匯到某家平面媒體的帳戶，名義是支付當時扁政府入聯公投的廣告費。
對此陳文彥弟弟供稱，他只是提供帳戶，也都有交易紀錄，而款項的轉移，都是哥哥陳文彥從美國打電話指定對象，要他匯錢給某家平面媒體。記者：「主任有這項情資嗎？」特偵組發言人陳雲南：「不清楚，不清楚。」
另外也傳出，FAPA前會長吳明基，涉嫌簽名領走拉美專案中的2千萬美金，儘管吳明基出面否認，不過檢方認為整個領款過程有問題，已於去年12月發動搜索，查扣相關證物，但因為事涉機密外交，加上還在偵辦中，特偵組對於這項情資，態度保留，但近期內將傳喚相關人士到案說明。
◎翻攝平面媒體
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