美聯社在1月4日刊登一篇文章，標題是「馬政府侵蝕台灣民主」，內容不但把馬總統和爆發水門案的美國前總統尼克森類比，還說馬總統縱容國民黨立委，影響陳前總統司法案件；這篇報導受到國內一家平面媒體引述，讓新聞局昨天深夜緊急發出新聞稿駁斥，強調如此相提並論實在太荒謬，總統府也重申，總統尊重司法，不會介入任何的司法案件。
就是這篇美聯社從台北發出的記者分析報導，標題是「馬政府侵蝕台灣民主爆爭議」，指稱馬政府介入陳前總統的司法案件，內容中還引述美國邁阿密大學教授金德芳的評論說，馬總統讓人聯想到前美國總統尼克森的行徑，下令國稅局，調查他不喜歡的對象。
內容還寫到，部份人士擔憂，國民黨立委施壓法務部，去調查民進黨政敵，當中包括陳前總統，立委也不斷運作，讓陳水扁在審判之前繼續被羈押，馬總統卻無力阻止。
報導裡還有台大教授王業立也批評，扁案最受外界干擾的，是國民黨立委把偵查內容洩漏給媒體。
如此沉重的批判，出自國外通訊社，甚至把馬總統類比為濫權、利用行政資源竊聽政敵的尼克森，讓總統府無法接受。
總統府發言人王郁琦：「總統他不干預各案，不把手伸進司法，和報導所指的外國元首的例子，根本是天差地遠，2個極端，對於立委各種言論，總統一方面也不會干涉，也沒有辦法干涉。」
新聞局在5日深夜，也罕見的緊急發出澄清新聞稿，痛批美聯社的報導荒謬，尤其指馬總統縱容國民黨立委、干擾陳前總統司法案件，更是毫無根據；府院同聲駁斥，就怕外電的報導，是選擇性的觀點，造成台灣民主形象的傷害。
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