九合一大選民進黨慘敗，蔡政府過去堅持的「2025非核家園」也遭公投結果打臉，但總統蔡英文在臉書強調，現行電業法將依法調整，但非核家園的目標不變。對此，「以核養綠」公投發起人黃士修留言質疑，多數民意否定非核家園，「您什麼時候要處理核一二三延役和核四重啟的問題？」更呼籲她放過民進黨。
針對「以核養綠」公投過關，蔡英文29日在臉書表示，非核家園是《環境基本法》明定的國家目標，政府在此目標下全力推動能源轉型，正成功帶領相關產業發展，「依照這次公投結果，行政部門將依法調整現行《電業法》中，強制核電除役的時限，但依據《環境基本法》，非核家園仍然是法定的目標。」
黃士修則在底下留言質疑，「全國絕對多數的民意支持以核養綠，否定非核家園。您什麼時候要處理核一二三延役和核四重啟的問題？2020總統和立委的選舉快要到囉，如果有必要我們可以提供每個選區同意以核養綠的比例參考。非核家園的天然氣政策出賣國家安全，沒有人想當賣台的罪人，請您放過民主進步黨吧。」
黃士修的回應引發千名網友按讚，不少人紛紛留言表達認同，指「日本都已經重啟核電了， 他們就是覺得日常乾淨便宜又穩定的電力跟不可知的風險比起來還是更重要」、「無賴，公投過了不認帳」；但也有許多人認為，核廢料問題不容忽視，加上核電廠的安全疑慮仍未解決，不能貿然延役或重啟，再度引發正反論戰。
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