交大研究報告指8成市售鮮奶營養流失，這樣的說法，在台大畜牧系引起震憾，台大表示，只要符合標準的高溫殺菌都沒問題，鮮奶中的乳球蛋白質，會隨加熱變性，轉附到酪蛋白質上，交大當然測不到，但變性不代表營養流失。
記者：「擁有超過40年歷史的台大實驗牧場，目前約有70頭乳牛，生產的鮮奶在大台北地區遠近馳名，幾乎天天都缺貨。」
台大畜牧系主任陳保基：「我們是採取81度30秒(殺菌)，它鮮奶的營養價值，和市售鮮奶是一樣的。」
系主任強調，只要在符合標準的高溫下殺菌，鮮奶品質都沒問題，這樣的說法和交大的看法明顯不同 而在牛奶加工界有教父之稱的林教授，看到交大的報告，也高度質疑。台大畜牧系教授林慶文：「(乳球蛋白質)通常是加熱到60度開始變性，這個變性主要是附在酪蛋白上面，不是流失，是變性的問題，變性後也是營養。」
台大指出，按照聯合國標準，135度以上採取超高溫瞬間殺菌，72度到85度採取高溫短時間殺菌，不可能有營養流失的問題，而牛奶中的蛋白質以酪蛋白最多，乳球蛋白質只有7%到12%。而對於有部分人士建議牛奶不宜加熱飲用，台大也提出澄清。台大畜牧系主任陳保基：「加熱不超過40度，對營養成分沒有影響。」
台大表示，加熱如果超過40度就會燙嘴了，只要不要太高溫都沒問題，交大報告在台大內引起震憾，農委會則是引用台大說法，呼籲消費者多喝牛奶有益處，營養不打折。
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