關說案演變成9月政爭，特偵組偵辦過程中，對柯建銘進行監聽，卻意外查出「案外案」，被批評是濫權監聽，而還沒偵結，檢察總長黃世銘就上報總統，以及公布監聽譯文，涉及洩密，外界質疑是「政治打手」，被批評是「明朝東廠」，只是為何特偵組會有這麼多爭議，法界人士認為，檢察總長是總統提名，總長又可以自己選擇團隊中的檢察官人選，難免不會沾染政治色彩。
電影裡，明朝東廠錦衣衛，專門幫皇帝執行秘密清算任務，使命必達，關說案扯出政治鬥爭黑幕，當初從查黑中心轉型，風光揭牌，誓言打老虎的特偵組，卻在這次風暴中，被比喻成政治打手，像是明朝東廠。國民黨立委呂學樟：「如果他越級和總統做報告，這點我們是很質疑的。」
特偵組獨立出來，當初用意是為了打老虎，正副總統、五院院長，專辦大官的貪瀆案、重大刑案，像是調查林益世貪汙案，揪出收賄內幕，外界肯定，不過成軍快7年，很難不沾染政治色彩。
民進黨立委吳宜臻：「檢察總長他是總統提名的，檢察總長他自己本身可以去到各地檢署，各個檢察署法院去挑，他認為他屬意比較適合跟著他辦案的檢察，他在挑選過程當中，他絕對會有篩選，特偵組制度裡面充滿著人為介入的色彩。」
新會期還沒到，立院就有人提出要修「法院組織法63條之一」，廢掉特偵組，或是刪減預算縮編，因為關說案監聽柯建銘查貪汙，意外聽到他和王金平對話，特偵組擴張權力調查，公布監聽譯文也被批評是洩密，2008年馬總統就職演說這一席話，如今聽來格外諷刺。總統馬英九(2008.5.20)：「台灣的民主將不會再有非法監聽，選擇性辦案。」
監聽都得申請監聽票，掛線時間也有限制，就怕政府單位利用權力進行政治偵防，讓國安局、調查局或特偵組，淪為針對特定人士的政治情蒐工具，但卻沒想到關說案，爆發這麼大的爭議。
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