高鐵75億資金缺口，最後由航發會和中技社、分別投資45億和30億填補，此舉引發華航工會眾怒，工會理事長李昭平怒斥行政院，把航發會當凱子，除了將控告航發會，也不排除動員前往機場，向即將返國的陳水扁總統抗議。
75億資金確定到位，高鐵趕在9月30日深夜，發送簡訊通知媒體，不過這75億資金，卻是在行政院運作下，由航發會和中技社出資，華航公會理事長李昭平，怒斥行政院把航發會當凱子。
華航工會理事長李昭平：「航發會是凱子，如果做這種決定，我們認為，是利用職權圖利他人。」
前陣子油價飆漲、航空公司成本增加，工會向航發會申請優惠融資，航發會推說沒錢，結果行政院宣布金援後短短兩天，45億資金就準備好，會不會太離譜？
李昭平：「非常離譜，雖然高鐵是國家重大工程，該做的，但不應該航發會出錢做，就像原本要捐錢做孤兒院，結果怎麼會做理髮院。」
目前高鐵持股最多，分屬大陸工程、太電、長榮等，原始五大股東，航發會和中技社投資後，再加上中鋼、官股銀行，法人持股排行位居第二，其他還有台糖、開發金等政府及國營事業，官股以外法人、自然人和僑外投資。
華航工會強調，航發會基金，本來就應該用在航空事業上，憑什麼替高鐵買單？工會考慮控告航發會，也不排除10月2日動員人力到機場，向即將回國的陳總統抗議！
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