總統大選期間，總統馬英九說，他會邀請蕭萬長擔任副手，是要借重他的經濟長才，就任後，他要讓蕭副總統擔任經濟總設計師。但是現在卻傳出，蕭副總統在新政府中被邊緣化，連辦公室編制，都從呂前副總統15人的規模銳減到4人。雖然幕僚澄清，副總統的角色本來就是備位性質，但是對照馬總統選前要重用蕭萬長的說法，顯然大不相同。
司儀：「歡迎中華民國副總統。」
台上口沫橫飛，大談台灣經濟競爭力，致完詞蕭副總統卻出人意表，竟然還有時間，聽完超過1小時的演講，強烈的對比是，身為活動主人的張榮發，公務卻忙到得先走人。記者：「新政府做的如何？」張榮發：「...。」
沒有緊鑼密鼓的會議和滿檔行程，副總統就連辦公室編制，也銳減到只剩三分之一，比一比就知道，呂前副總統辦公室編制當初高達15人，蕭副總統進駐後，縮編到只剩下主任、秘書、參議和專門委員4個人。前副總統呂秀蓮(2006.3.6)：「你們不只一位，用深宮怨婦描繪我。」
即使是被形容成深宮怨婦的呂前副總統，任期內還是肩負不少責任，包括總統府人權小組召集人、科技委員會主委、文化總會副會長、監委審薦小組召集人，一人身兼數職，再看看蕭副總統，只兼了個考監委審薦小組召集人，而且還是已經結束的階段性職務，這是不是和當初馬總統選舉時的說法不一樣？時為總統參選人馬英九(96.6.23)：「他經濟舵手風格，能夠帶領台灣脫離經濟困境。」
不是說要找來蕭萬長擔任台灣經濟總設計師嗎？不過現在的蕭副總統，不是當男配角，陪總統見見賓客，就是偶應邀致致詞，空有一肚子經濟專業，手腳卻似乎難以施展，傳出一切都是因為馬總統有個綽號影武者的幕後軍師，副總統在財經政策的角色遭到邊緣化。記者：「副總統，為什麼覺得有人住總統府夾層屋？」副總統蕭萬長：「...。」
外傳有感而發的這段話，副總統笑而避談，透過幕僚澄清，副總統是備位元首性質，角色本來就不該太突出，況且府院黨高層會議，也都出席，當面向總統提建言，沒有邊緣化的問題。
只是，微笑老蕭是經濟總計畫師，還是另一個坐4年冷板凳的深宮怨男，主導權，在馬總統手上。
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