前故宮博物院院長馮明珠卸任後接受北京故宮聘用，擔任研究顧問，引發爭議，馮明珠表示不願造成台北故宮困擾，因此決定辭職，並且用信函方式告知北京故宮，她也強調，是在卸任後才獲北京故宮邀請擔任顧問，絕對不是卸任前就找好出路，將管制年限從3年改到3個月圖利自己。
國立故宮博物院前院長馮明珠：「沒有想到會造成社會這麼多紛擾，也造成我自己很大的困擾。」
嘴裡說沒想到，卻還是在卸任3個月短短時間內，從國立故宮博物院轉任北京故宮研究院顧問，但這顧問壽命不到1個月，就劃下句點。
信函寫著「本人10月3日起，辭去故宮研究院顧問頭銜，造成各方困擾深以為憾。」馮明珠更在底下親筆簽名蓋章，但已經返國人在新北的她，還以雙掛號火速寄給北京故宮院長鄭欣淼，就怕事情愈演愈烈。
因為就陸委會初步認定，北京故宮研究院屬於禁止機構，已經啟動行政調查，如果符合任職定義，最重可處3年有期徒刑，或併科50萬以下罰金。
國立故宮博物院前院長馮明珠：「它沒有固定的工作、也沒有固定的工作項目、也沒有固定薪資也沒有任期，所以它屬於一種虛形。」
澄清顧問只是服務性質、貢獻所學，但外界質疑馮明珠不僅有洩密疑慮，為了轉任，還申請將管制年限連改3次，而從3年調為3個月，就陸委會認定公務員應自行迴避，故宮處理有瑕疵，要撤銷處分。
國立故宮博物院前院長馮明珠：「我實在不懂，如果我們真的涉及到國家機密，我想當初也不會同意簽署公文。」
反擊當初公文是主管機關簽過的，馮明珠也再三重申，曾任國家政務官的她絶對會遵守國家法律，這次雖以請辭收場，但是在調查出爐前，恐怕事情還難以落幕。
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