王金平雖然還沒有公開說明，但是打了電話給總統，否認關說，通話只是安慰柯建銘的話語，但對此總統完全不認同，他說「如果這不叫關說，那什麼才叫關說」。
總統馬英九(2013.9.8)：「自從最高檢特偵組揭發立法院長關說司法個案以來，已經進入第3天，經過3天的思考，我決定發表這份沉痛的聲明，立法院長為了最大在野黨黨鞭的司法案件，關說法務部長及台高檢檢察長，這是侵犯司法獨立最嚴重的一件事，也是台灣民主政治、民主法治的發展，最恥辱的一天，如果我們不能嚴正面對這樣弊案，台灣將走上無限沉淪的處境，昨天我呼籲王金平院長儘快回國說明之後，人在國外的王院長打電話給我，除了說明他無法立刻回國的原因外，也解釋他並沒有關說司法個案，他說他只是在安慰柯建銘總召，並且曾勇夫部長幫忙處理，這個做法談不上關說，我們每個人都可以問自己，如果這不是關說，那什麼才是關說。」
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