康芮颱風造成雲嘉南地區大淹水，有的縣市一早緊急宣布停班、停課，有的則是下午才停班、停課，民眾抱怨連連，內政部長李鴻源不客氣砲打地方，強調內政部早就研判南部會受到重創，但電話提醒地方政府成立緊急應變中心，部分縣市卻不配合，動作慢了好幾拍，儘管李鴻源不肯點名不聽話是哪個縣市，但根據內政部的電話通報紀錄顯示，嘉義縣和彰化縣成立應變中心的時間都比其它縣市晚。
掌握颱風災情，中央部會首長赴防災應變中心報到，內政部長李鴻源和馬總統溝通超順暢，但對地方政府卻是怎樣都叫不動。
內政部長李鴻源：「特別交代、打電話，南部的這幾個縣市起碼要做到2級開設，結果到昨晚9點半還有幾個南部縣市沒有開。」
南部縣市是誰不聽話？李鴻源不肯點名，只是內政部從28日下午5點開始打電話提醒再提醒，屏東、高雄、台南、雲林、南投，或早或晚都乖乖開設應變中心，就是嘉義縣沒動作，一直到了晚上10點半，內政部2度通知後才開設，彰化縣更是等到29日中午才成立。
李鴻源：「問題關鍵不在它(雨量)準不準，而是說我們已經特別告訴你，你一定要開設(應變中心)，這才是重點，我們告訴你要開設，你是一定要開設。」
部分縣市政府忙解釋，是雨量預測不準，才會沒及時開設應變中心，面對中央下指令，地方政府不甩，內政部來硬的。
李鴻源：「到了(晚上)9點多實在不得已，因為他們都不開設，我最後告訴國軍、告訴原民會說，我們直接跳過政府，直接找山地鄉(撤離)。」
淡淡敘述來龍去脈，但聽得出有無奈、有不滿，地方政府警戒動作慢半拍，苦的是被淹慘的老百姓。
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