根據12年國教的立法精神，最終極的目標，就是要達到所有學生可以免試入學，只是，這樣的概念也衝擊所有的明星高中，因為現在免試入學門檻，從預期的15%，一口氣拉高到25%，台北市四大明星高中校長表示，學生素質的差異化將會擴大，成功高中校長李慶宗甚至表示，如果免試入學的門檻再拉高至30%，屆時所謂的明星高中，將會是私校的天下。
北一女校長張碧娟：「25%，必然會給我們這樣的學校帶來一些衝擊，因為本來我們學生的素質都很整齊，那未來的學生，勢必異質性很大。」
語氣中還是有無奈，因為12年國教把免試入學門檻，從15%一口氣調高到25%，一點妥協空間都沒有，衝擊最大的，就是向來有光環加身的明星高中。
中山女中校長楊世瑞：「公立學校跟私立學校，整體我們來看的話，這個立法太傾向私立學校，公立學校的部分，一定會被很多限制綁住，可是私立學校的這個部分，我們覺得在這個法令上面，我們看到是非常寬鬆的。」
其實會擔心不是沒道理，因為不管是課程還是課綱，都還沒準備好，政策倉促上路，配套也不完全，公立高中似乎成了「改革箭靶」，連成功高中校長李慶宗也批評，免試入學門檻，如果達到30%的臨界點，就是變相動搖明星高中地位，這樣一來，學生轉向私校求學的比例，可能大幅提高。
但無計可施下，現在學校方面也只能積極因應，包括加強補救教學、差異化教學，或是採用多元評量的方式，企圖讓免試和特招生，都有公平選擇特色課程的機會。
楊世瑞：「高級中學的課綱，其實目前只有微調，它並沒有真正去理解，未來9年國教的課程綱要，因此在這樣的情況之下，看起來其實未來要面對的挑戰，還非常的大。」
張碧娟：「差異化教學，是我們要去強調的，另外還有學生的補救教學，還有多元評量的教學方法，不能再用一份考卷去考所有的學生，應該按照學生的程度不同，而設計一些多元評量的方式。」
只是辦學被政策框架給限制住，這樣一來，恐怕也讓12年國教淪為「免試入學、私下分班」，造成學生標籤化的最大元凶。
