馬政府上任後1年來，最引以自傲的成績單，就屬兩岸外交政策！不但兩岸關係融冰速度，超乎預期，三次江陳會一共簽署9項協議，兩岸經貿合作大躍進；外交上，也因為力主外交休兵，獲得重大突破，台灣拿下38年以來，WHA觀察員的門票；不過兩岸外交的亮眼成績單下，卻是朝野因為缺乏共識，尖銳的對峙情勢，在野黨質疑兩岸關係走太快，讓台灣淪入喪失主權，必須仰大陸鼻息生存的疑慮，成為馬政府未來必須面對正視的課題。
馬總統：「不統、不獨、不武。」
520就職當天，馬政府高分貝宣示兩岸政策底限，就此展開前所未有的破冰交流，兩岸融冰速度超乎想像，6月隨即展開復談，江陳這一會，寫下兩岸歷史新頁。
大陸海協會會長陳雲林：「我們兩岸的雙手，再次緊緊的握在一起。」
從第一次江陳北京會談、台北會談，再到南京會談，短短不到1年，兩岸舉行了3次江陳會。通郵、通航、外加兩岸金融，江陳簽署九項協議，兩岸空運更是劃破時間空間限制，從包機直航，一舉躍進成為每月270班的定期航班，兩岸關係高速發展的同時，卻更加深在野黨一昧親中恐喪失主權的憂慮，台灣朝野尖銳對立，急劇升高。抗議民眾：「台灣、中共，一邊依國。」
憂心馬政府守不住主權，在野黨這股疑慮，在陳雲林來台那一刻，升溫到最高點，即使隨著陳雲林離台暫獲平息，馬政府隨即提出的兩岸經濟合作協議，名稱從CECA一路修改為ECFA，卻更加劇在野黨質疑聲浪。民進黨主席蔡英文：「請他在5月17日的那天，豎起耳朵，聆聽街頭傳來的人民怒吼。」
在野黨質疑兩岸關係爆衝，就連對岸學者也有人訝異兩岸互通走太快，在野黨和大陸學者竟有意外的共同體認，成為馬政府兩岸政策中不得不正視的聲音。兩岸關係學者張五岳：「主張走得比較快的人的比例，確實相較於一年前比重是比較多，(因為)有關外交的問題，第二個有關於國防的問題，第三個有關於兩岸之間涉及到主權相互定位問題，這些問題目前為止，只是循著個案解決的方式。」馬總統：「外交休兵，它不是外交休假，更不是外交休克。」
外交上，馬政府祭出外交休兵，邦交國23這個數字無增無減，但是大部分聯合國組織活動，台灣不得其門而入；在野黨連番質疑，外交休兵根本毫無作為，反而退讓主權。
兩岸外交學者賴岳謙：「中共一直不停的在打壓台灣，對中共未來也不會有好處，原因很簡單，就是一直打壓台灣，最後就是讓台灣跟大陸不斷疏離。」馬英九：「大陸當局也體現了去年12月31日胡六點的精神，對這個議題採取務實善意的態度。」
對岸點頭推薦下，台灣終於取得38年來WHA第一張入場券，往後每年資格審查，台灣是不是能穩坐觀察員位置，還得看大陸臉色。馬政府最引以自傲的外交兩岸政策，兩張成績單，分數決定權都在對岸善意的放與不放之間，馬政府，儼然陷入仰人鼻息，流失迴旋空間的處境。
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